AP
а какой бэкграунд (образование и интересы)
и да, биоинформатику интересно или wetlab
и да, биоинформатику интересно или wetlab
Size: a a a
2021 April 13
DR
Нене, тут дипломы подавай
S
круто, можно было пихнуть и RNAseq, и single cell, и даже работу в Galaxy, для не любителей командной строки, Variant calling
S
наверно я размечтался
AP
не
в сингл селл ОЧЕНЬ много всего своего, это вылезает уже даже за отдельный курс
я всем советую атомную вещь вот эту: http://bioconductor.org/books/release/OSCA/
в сингл селл ОЧЕНЬ много всего своего, это вылезает уже даже за отдельный курс
я всем советую атомную вещь вот эту: http://bioconductor.org/books/release/OSCA/
A
образование - биохимик, но работаю с флуоресцентными метками + докинг, прогаю нормально. Интересует биоинформатика
AP
вариант коллинг тоже совершенно нельзя мешать с рнк-секом ) там реально БЕЗДНЫ, если брать организмы разной степени собранности, разной плоидности, соматические варианты, варианты из рнк-сека, варианты из сингл-селла
короче я не очень шучу что нгс это вселенная
короче я не очень шучу что нгс это вселенная
S
спасибо за материалы! у меня ещё кое-что от Кости Зайцева осталось после учебы в ИБ по scRNAseq
RS
area plot для каждого типа измерения... с убывающей прозрачностью. Наподобие этого (только вместо частотности, настоящие значения)
DR
А что для вариант коллинга сейчас рекомендуют для экзомов сделанных на торренте? Родной сьют?
ИК
А не кажется ли, что такой график на 11 типах просто будет нечитаемым?
AP
будет конечно
а сколько человек в группах?
а сколько человек в группах?
АС
Если вы мне подгоните работу с нормальной зп, я готов на неё хоть завтра выходить. А поскольку я уже подавался, и не один раз. И почти везде требуется диплом. В одном месте я не прошёл по знаниям, но там было по рекомендации.
AP
по дефолту для визуализации именно измерений надо что-то типа такого
https://lh3.googleusercontent.com/proxy/uVUQvlhtlv9J_00o64AKwmhZ8fABf7PJNir9jAsMZFyLZ0DPYAmOkaymEsU2DE_mBR2WwRhEd01yBgyH0UgK1iw4cx-PP0kxb4H6jXZD4UVn1OOBEBcplSPZhKAkKz5F3MZoyqGix04ENavta7zWTQIOzjaQP-buknT1Pfvj21Dq0tVKxdo9f6kKwWoLNueMgZLY1N2U8sB6MOgg8yvTXDgqQgnGIpCErmgrLaTcZH1Pno97hlAwInFimR3-5erFxt5c-XDgzuwHJ0a3o-HHEPV0Lw
серые здоровые желтые больные, 11 пар
https://lh3.googleusercontent.com/proxy/uVUQvlhtlv9J_00o64AKwmhZ8fABf7PJNir9jAsMZFyLZ0DPYAmOkaymEsU2DE_mBR2WwRhEd01yBgyH0UgK1iw4cx-PP0kxb4H6jXZD4UVn1OOBEBcplSPZhKAkKz5F3MZoyqGix04ENavta7zWTQIOzjaQP-buknT1Pfvj21Dq0tVKxdo9f6kKwWoLNueMgZLY1N2U8sB6MOgg8yvTXDgqQgnGIpCErmgrLaTcZH1Pno97hlAwInFimR3-5erFxt5c-XDgzuwHJ0a3o-HHEPV0Lw
серые здоровые желтые больные, 11 пар
AP
можно сделать их violin plots вместо боксплотов, можно нанести все точки а не только аутлаеры. именно значимость можно потом отдельно посмотреть (типичная фигня с линией и звездочками тут будет безумно сложной)
S
вы про работу биоинформатиком?
АС
S
мск?
DR
Подумал про виолончель плот, но там столько сразу всего)
ML
Для работы с зарплатой, конечно, диплом нужен. А точнее даже не диплом, а умения и готовность (и способность) приобретать новые. Для стажировки неоплачиваемой/малооплачиваемой - нет