SK
А как тогда говорят, когда вместе с bam идёт bai? Просветите неграмотную🤷♀
А что надо?;)
Добрый вечер!
Подскажите, где можно скачать проиндексированный bam файл для генома человека?
Спасибо!
Size: a a a
2021 February 16
AP
в смысле, бам с индексом может быть для конкретного образца
нет "bam файла генома человека" - есть референсная сборка, на которую выравниваются анализируемые образцы
что вы пытаетесь сделать, расскажите пожалуйста, тогда мы наверное сможем что-то подсказать
нет "bam файла генома человека" - есть референсная сборка, на которую выравниваются анализируемые образцы
что вы пытаетесь сделать, расскажите пожалуйста, тогда мы наверное сможем что-то подсказать
MR
Я просто хочу пример bam файла для человека (и проще сразу ведь с индексом). Верно, bam файлгенома человека нет,я не правильно выразилась. Для какого-то человека
З
подскажите, как на сайте рнф найти себя как исполнителя гранта? для ПГАC нужно
MR
в смысле, бам с индексом может быть для конкретного образца
нет "bam файла генома человека" - есть референсная сборка, на которую выравниваются анализируемые образцы
что вы пытаетесь сделать, расскажите пожалуйста, тогда мы наверное сможем что-то подсказать
нет "bam файла генома человека" - есть референсная сборка, на которую выравниваются анализируемые образцы
что вы пытаетесь сделать, расскажите пожалуйста, тогда мы наверное сможем что-то подсказать
Спасибо за разъяснение!
AP
Я просто хочу пример bam файла для человека (и проще сразу ведь с индексом). Верно, bam файлгенома человека нет,я не правильно выразилась. Для какого-то человека
а. тогда проще
в целом данные пациентов и вообще людей обычно по спецпропускам
но есть открытые - например, т.н. Genome In a Bottle
https://jimb.stanford.edu/giab-resources
там есть ссылки по которым можно скачать бам, советую брать какой-нибудь типа 30х - это типично для обычного WGS
в целом данные пациентов и вообще людей обычно по спецпропускам
но есть открытые - например, т.н. Genome In a Bottle
https://jimb.stanford.edu/giab-resources
там есть ссылки по которым можно скачать бам, советую брать какой-нибудь типа 30х - это типично для обычного WGS
АС
а. тогда проще
в целом данные пациентов и вообще людей обычно по спецпропускам
но есть открытые - например, т.н. Genome In a Bottle
https://jimb.stanford.edu/giab-resources
там есть ссылки по которым можно скачать бам, советую брать какой-нибудь типа 30х - это типично для обычного WGS
в целом данные пациентов и вообще людей обычно по спецпропускам
но есть открытые - например, т.н. Genome In a Bottle
https://jimb.stanford.edu/giab-resources
там есть ссылки по которым можно скачать бам, советую брать какой-нибудь типа 30х - это типично для обычного WGS
Саша, а сложно в институт биоинформатики попасть на программу переподготовки, как информатику? Которая онлайн. Насколько нужно соответствовать всем требованиям?
AP
Саша, а сложно в институт биоинформатики попасть на программу переподготовки, как информатику? Которая онлайн. Насколько нужно соответствовать всем требованиям?
привет! я не 100% в курсе дел - можно написать на инфо почту, они подскажут. Зависит от конкурса больше всего, наверное - не знаю, какой он..
АС
привет! я не 100% в курсе дел - можно написать на инфо почту, они подскажут. Зависит от конкурса больше всего, наверное - не знаю, какой он..
Привет! Спасибо. Ну я подал заявку. Просмотрел требования и мне стало страшновато. Ибо я часть этого была очень давно и уже успел часть забыть. А части и не было.
AP
Привет! Спасибо. Ну я подал заявку. Просмотрел требования и мне стало страшновато. Ибо я часть этого была очень давно и уже успел часть забыть. А части и не было.
обязательно надо пройти курс - это будет преимуществом
также можно пройти те курсы, которые указаны в разделе "освежить знания" )
также можно пройти те курсы, которые указаны в разделе "освежить знания" )
SV
подскажите, как на сайте рнф найти себя как исполнителя гранта? для ПГАC нужно
исполнителя вроде бы только изщнутри исстемы иас. руководителя через вот эту ссылку https://rscf.ru/contests/search-projects/
LD
Не так страшен черт, как его малют, скажу. Всем требованиям соответовать не реально будет, но знать и главное уметь соображать надо. Если додумаешся до чего-то на собеседовании, то это будет даже плюсом
АС
обязательно надо пройти курс - это будет преимуществом
также можно пройти те курсы, которые указаны в разделе "освежить знания" )
также можно пройти те курсы, которые указаны в разделе "освежить знания" )
Клёво) Спасибки)
АС
Не так страшен черт, как его малют, скажу. Всем требованиям соответовать не реально будет, но знать и главное уметь соображать надо. Если додумаешся до чего-то на собеседовании, то это будет даже плюсом
Спасибо)
LD
Может в лс написать спросить, если что
АС
Может в лс написать спросить, если что
Ок
🐈
Саша, а сложно в институт биоинформатики попасть на программу переподготовки, как информатику? Которая онлайн. Насколько нужно соответствовать всем требованиям?
С т.з. студента-информатика ИБ скажу, что учиться сложнее, чем попасть)
АС
С т.з. студента-информатика ИБ скажу, что учиться сложнее, чем попасть)
Как и в любом нормальном учебном заведении. Но ещё надо попасть
SV
С т.з. студента-информатика ИБ скажу, что учиться сложнее, чем попасть)
обычно про физфак так :)
АС
Semen Vasilev
обычно про физфак так :)
Да про любой физмат