Size: a a a

2020 December 17

EZ

Ekaterina Zharkova in Science FYI
Дорогие друзья!
Если кто-нибудь из вас готов пообщаться и поделиться своим опытом учебы в аспирантуре, поотвечать на глупые и не очень вопросы, пожалуйста, напишите мне в личку
источник

O

Orodret in Science FYI
Paulina D
Нет, три 180 пн и три -- 400 (средние длины)
А короткие получается два раза будут прочитаны? оО
источник

ОП

Ольга Пузикова... in Science FYI
Подскажите, пожалуйста, где в РФ лучше аспы по генетике/бинж/бинф. Меня интересуют прикладные аспекты
источник

АС

Александр Смирнов... in Science FYI
Ольга Пузикова
Подскажите, пожалуйста, где в РФ лучше аспы по генетике/бинж/бинф. Меня интересуют прикладные аспекты
Может @aozalevsky подскажет
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Ольга Пузикова
Подскажите, пожалуйста, где в РФ лучше аспы по генетике/бинж/бинф. Меня интересуют прикладные аспекты
а что тут думать?) сколтех, вестимо)
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
но вообще сейчас сейчас и в МГУ (ФББ/Биофак) станет поинтереснее. Появилась новая интересная аспирантская программа по машинному обучению, которая дает неплохой бонус в стипендию.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
но вообще в РАНовских институтах сейчас тоже неплохо с биоинф аспирантурами. В частности ИБХ, ИБГ. Вот недавно @kehrlaehda искали себе аспиранта-биоинформатика. в ИБХ тоже всегда востребованы. можно у меня и @mikessh спросить
источник

ОП

Ольга Пузикова... in Science FYI
Arthur Zalevsky
а что тут думать?) сколтех, вестимо)
Большое спасибо, Артур, за инфу)
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Orodret
А короткие получается два раза будут прочитаны? оО
нет, длина ридов с одного конца 75, а со второго вообще 28
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Mike Sh
разница в том что у тебя короткие забьют все длинные если мне не изменяет память
ну, а если концентрацию коротких поменьше сделать
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Ekaterina Zharkova
Дорогие друзья!
Если кто-нибудь из вас готов пообщаться и поделиться своим опытом учебы в аспирантуре, поотвечать на глупые и не очень вопросы, пожалуйста, напишите мне в личку
аспирантура по какой специальности? в какой стране?
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Ekaterina Zharkova
Дорогие друзья!
Если кто-нибудь из вас готов пообщаться и поделиться своим опытом учебы в аспирантуре, поотвечать на глупые и не очень вопросы, пожалуйста, напишите мне в личку
какие вопросы?
источник

O

Orodret in Science FYI
Paulina D
нет, длина ридов с одного конца 75, а со второго вообще 28
Какие короткие риды! оО
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Orodret
Какие короткие риды! оО
75 -- нормальный рид же для иллюмины
источник

O

Orodret in Science FYI
Paulina D
75 -- нормальный рид же для иллюмины
Нет, мы меньше 100 никогда не заказывали. Сейчас в основном 150 заказываем
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Orodret
Нет, мы меньше 100 никогда не заказывали. Сейчас в основном 150 заказываем
ок) мне их не надо потом собирать, если что. Просто замэпить на транскриптом
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
тут смысл не в ридах а в длине фрагмента
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
28 наверное с учетом + адаптеры всякие
источник

O

Orodret in Science FYI
Paulina D
ок) мне их не надо потом собирать, если что. Просто замэпить на транскриптом
Да не, я просто удивился длинам. И кста не знал, что их разной длины можно делать...
источник

MS

Mike Sh in Science FYI
иногда полезно первый рид длиннее второго делать
источник