МК
А сколько векторов?
Size: a a a
2020 February 26
AD
да публикуют survival rate на нем, и subG1/G1 графики, и как хош можно найти, особенно если тип гибели не важен. Ну главное только от тех дебриса отделять, а то уж совсем всякое бывает
Ок, спасибо.
SK
700 x 100
G
(признаться что ли что у меня самое интересное пока показывает скользящее среднее по pairwise jaccard?)
блин интересная задача но надо курить и трогать данные)
SK
ну понятно что если делать iou то это будет тупо 700x700
SK
Ну ладно, щас будет лаб митингш, может чего посоветуют
МК
Это количество или размер?
SK
700 наблюдений, каждое размером 100
SK
ну это на одной хромосоме, а их много
G
mutational rate что ли?
SK
MS
А чому сперва не сгруппировать по mutual information и смотреть на значения для групп?
MS
Какая задача то? Найти связи между компонентами вектора длиной 100?
G
Ну там ещё скрытые состояния
G
Когда меняется состояние генеративная модель меняется плюс зависимость внутри самой модели от соседних наблюдений
SK
German
Когда меняется состояние генеративная модель меняется плюс зависимость внутри самой модели от соседних наблюдений
Ура значит это кто то может понять кроме меня из моего корявого описания
SK
короче я пока остановлюсь на сетапе "Декомпозиция + HMM поверх этого", на изветсных биоологических примераз это показывает интересные результаты. Конечно это model selection уровня бог, но для биологии сойдет
G
Я боюсь что nmf о скрытых состояниях тоже не знает и будет делать как будто их нет
G
Я когда cnv искал та же проблема была но у меня бесплатное предположение было что точка зависит только от соседей
G
Ну и все модели можно было из головы понять