ПМ
И юзаются ли там всякие квантмех методы?
Size: a a a
2020 January 07
SK
Что то было от alpha тимы про фолдинг
ПМ
мне просто утверждают
ПМ
что "ничего не моделируется, математическое моделирование в биологии для белков не работает ибо биология сложнее физики"
d
Друзья, кто-нибудь разбирается в маках? Для работы
ПМ
вот мне интересно, так ли это
SK
Биология сложнее физики? Сильно.
d
Сложнее
BK
потому что его первое правило про крабов.
А разве не убраться в комнате?
BK
Хм. Мне тут сказали что сейчас третичная структура белков не моделируется адекватно. Ето правда?
ПМ
из за сложности, неадекватности моделей (они классические вроде в основном) или чего то еще?
BK
из за сложности, неадекватности моделей (они классические вроде в основном) или чего то еще?
Все это одновременно
AZ
Хм. Мне тут сказали что сейчас третичная структура белков не моделируется адекватно. Ето правда?
смотря что понимать под моделированием)
AZ
для всяких случаев 3+ белков
ну да. и рибосому уже лет 20 тоже не моделируют полноатомно;)
ПМ
смотря что понимать под моделированием)
моделирование белок-белковых взаимодействий и предсказание третичной структуры по аминокислотам
ПМ
ну да. и рибосому уже лет 20 тоже не моделируют полноатомно;)
я не разбираюсь в биологии, посему не знаю - это ирония или нет?
AZ
моделирование белок-белковых взаимодействий и предсказание третичной структуры по аминокислотам
аб инишио предсказание 3д сейчас очень узкая задача. для большинства клинически-значимых объектов уже есть структуры гомологов, по которым можно неплохо восстановить структуру мишени.
AZ
белок-белковый докинг, км/мм расчеты реакций и сложных эффектов, расчеты конформаций в мембранах, расчеты физ.хим и экспериментальных свойств по данным моделирования - все это более-менее рутинные задачи. была бы необходимость)
BK
белок-белковый докинг, км/мм расчеты реакций и сложных эффектов, расчеты конформаций в мембранах, расчеты физ.хим и экспериментальных свойств по данным моделирования - все это более-менее рутинные задачи. была бы необходимость)
Работает ето все через одно место правда