Marina Afanasyeva
Нужен совет по риал-тайм пцр! Надо детектировать человечий IKZF3 универсальными праймерами на все изоформы. Единственные общие экзоны - 1 и 2. РНК здоровая - больше 6000. Олиго дТ не подходят ведь, слишком далеко? А если брать рэндом праймеры, какие у этого будут побочные эффекты? И с какого конца быстрее деградирует мРНК?
А почему не хотите воспользоваться готовым Taqman gene expression? Есть комплект на все 16 изоформ, правда там праймеры в одном экзоне, так что если есть примесь геномной ДНК - будут артефакты. Есть праймеры в разных экзонах, но там выпадает 14 изоформа