Size: a a a

2019 November 19

E

Ego te saluto in Science FYI
Alex Beliavskaia
А, а то я подумала ты мне в бровисты посоветовал с таким гпа идти
нит, лол
источник

T

Theia Draizer in Science FYI
Mia Dos Santos
Дыа, все верно
«Трёхгранная пирамида»
not bad
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
German
Криспером вроде около процента эффективность
Это другой криспер, инвитро. Он работает с отличной эффективностью
источник

T

Theia Draizer in Science FYI
Кто-нибудь знает хороший цикл лекций/онлайн курс по эмбриогенезу? И эндокринологии.
источник

G

German in Science FYI
Alexander Predeus
Это другой криспер, инвитро. Он работает с отличной эффективностью
Надо почитать..
источник

O

Orodret in Science FYI
Arthur Zalevsky
Чатик, а кто-нибудь что-нибудь знает про это заведение в питере:
«Государственный научно‑исследовательский институт особо чистых биопрепаратов» Федерального медико-биологического агентства
https://hpb-spb.com/ru/
Если что, знаю нескольких людей оттуда))
источник

ИК

Иван Котомин... in Science FYI
Vasily Popkov
Коллеги. Тут иногда похожие вопросы задают. Задам и я.
Нам тут с шефом надо людей в выпуск по узкой теме набрать. Есть какой-то простой способ получить список статья - мыло кореспондинга - импакт по ключевым словам?
Ключевое тут, думаю, мыло и импакт журнала. Хочется разумную отсечку сделать. Пока идея только руками в wos
Что значит "в выпуск"?
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
И если да, то чувак ваще не понимает, что делает
Тут даже не в снипах дело, а в коротких франментах. Жечь поры с н50 ниже килобазы - деньги на ветер
источник
2019 November 20

O

Orodret in Science FYI
Alexander Predeus
Кусочки мелкие, надо другой энричмент. Сейчас криспром клёво делают. Типа режешь где не надо, остальное секвенируешь, длинными ридами, как велел Иисус
А как тут короткое убрать, это ж не белый медведь с гемоглобином что ли?
источник

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI
Ну нанопору используют не только из-за длины, есть те, кому например важна скорость. Выделил — залил — вечером результат, а не месяц иллюмину ждать
источник

O

Orodret in Science FYI
Alex Beliavskaia
Ну нанопору используют не только из-за длины, есть те, кому например важна скорость. Выделил — залил — вечером результат, а не месяц иллюмину ждать
Там поры сдыхают от циклов смены ридов. Если риды короткие, то поры сдохнут быстрее, прочитав меньше букв. Хотя если денег не считать, то и так норм
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
Orodret
А как тут короткое убрать, это ж не белый медведь с гемоглобином что ли?
ну для условного эукариота, можно сделать типа несколько сотен последовательностей на повторы, и нарубаешь их меленько. дальше обычный гель, и будет типа обогащение 10-20% генома без повторов.
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
еще есть трюки с фосфорилированием
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
экзом полноценный вроде еще никто не сделал на этом принципе, но куски медицински важных генов в 100-200 кб размером уже вовсю фигачат в куче лабораторий - видимо, и правда хорошо работает.
источник

O

Orodret in Science FYI
Alexander Predeus
ну для условного эукариота, можно сделать типа несколько сотен последовательностей на повторы, и нарубаешь их меленько. дальше обычный гель, и будет типа обогащение 10-20% генома без повторов.
Да, не сразу врубился, что можно не как экзом готовитить, а сразу лишнее в геноме порубить. Интересно, а на стадии готовой либы можно через гель сайз селекшн сделать
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
готовой для нанопоры напряжно наверное. там же сразу протеин висит вроде.
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
ну и лишняя трата лигаз и адаптеров )
источник

O

Orodret in Science FYI
До пришивки белковых кусков))
источник

O

Orodret in Science FYI
А ферментов там и так ведро уходит.
источник

E

Ego te saluto in Science FYI
Orodret
Там поры сдыхают от циклов смены ридов. Если риды короткие, то поры сдохнут быстрее, прочитав меньше букв. Хотя если денег не считать, то и так норм
поры сдыхают за 48 часов
был нанопор в прошлой лабе
источник