Size: a a a

2019 September 02

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Siddim
Его ещё используют?
Ты Pfam/Rfam и Ensembl используешь?
источник

S

Siddim in Science FYI
Boris A. Burkov
Ты Pfam/Rfam и Ensembl используешь?
Нет.
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Siddim
Нет.
Значит их используют те, кого используешь ты =)
источник

S

Siddim in Science FYI
Boris A. Burkov
Значит их используют те, кого используешь ты =)
Просто от перла отказываются в других сферах, сейчас скорее на нём легаси-код.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Siddim
Просто от перла отказываются в других сферах, сейчас скорее на нём легаси-код.
от кобола вон тоже отказываются. уже 50 лет как отказываются :(
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
а уж сколько от второго питона теперь будут отказываться...
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Siddim
Просто от перла отказываются в других сферах, сейчас скорее на нём легаси-код.
Разумеется-разумеется. Но, к сожалению, этого легаси слишком много, чтобы переписать.

А в телекоме его застряло еще больше. Видел бы ты, как народ страдает в каком-нибудь Водафоне...
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Arthur Zalevsky
а уж сколько от второго питона теперь будут отказываться...
Думаешь, будет так долго и больно? Мне кажется, индустрия в основном перешла. В академии, особенно биоинфе, вот могут застрять наверное, особенно если сишные расширения.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
мое любимое - автодоктулз. ультра популярный набор софтин для докинга. но они еще под питон 2.6 а внутри еще зависимость от нампая < 1.8.  и, самое смешное, есть версия под 2.7, выпущенная еще лет 5-6 назад. но ее надо хитро из ночных сборок доставать :)
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
так вот захочешь - не найдешь на сайте линк)
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Arthur Zalevsky
мое любимое - автодоктулз. ультра популярный набор софтин для докинга. но они еще под питон 2.6 а внутри еще зависимость от нампая < 1.8.  и, самое смешное, есть версия под 2.7, выпущенная еще лет 5-6 назад. но ее надо хитро из ночных сборок доставать :)
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
о этот мир пакетов для всяких физических симуляций
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Их точно написали не нацисты руками военнопленных? Не могу представить, как человек может по доброй воле таким заниматься.
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
отдельное хаха - пока громакс собирались сделать полноценное питон-апи, питон мало того что сменил 2 на 3, скоро уже 4й выкатят. а стабильного апи так и не будет :)
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Arthur Zalevsky
отдельное хаха - пока громакс собирались сделать полноценное питон-апи, питон мало того что сменил 2 на 3, скоро уже 4й выкатят. а стабильного апи так и не будет :)
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Не понимаю я людей, которым комфортно и интересно десятилетиям тащить какую-нибудь софтину в одно рыло. Да, они бывают, но я их не понимаю.
источник

DP

Dmitry Penzar in Science FYI
Arthur Zalevsky
отдельное хаха - пока громакс собирались сделать полноценное питон-апи, питон мало того что сменил 2 на 3, скоро уже 4й выкатят. а стабильного апи так и не будет :)
Таки есть сообщения о 4й версии?
источник

AZ

Arthur Zalevsky in Science FYI
Dmitry Penzar
Таки есть сообщения о 4й версии?
https://www.python.org/dev/peps/pep-0563/#implementation

> In Python 4.0, function and variable annotations will no longer be evaluated at definition time.
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
Arthur Zalevsky
перл :( то есть для меня равносильно бинарнику.
прокка - это обертка для всего на свете
сам по себе для предсказания генов он использует Prodigal
который сейчас state-of-the art в предикшене бактериальном. и его конечно можно поставить отдельно.
источник

BB

Boris A. Burkov in Science FYI
Dmitry Penzar
Таки есть сообщения о 4й версии?
Пишут, что 4.0 будет после 3.9.

Вот бы Клифф Клик все-таки подключился и сделал питону нормальный JIT.
источник