AP
В mggm
Size: a a a
2019 August 08
AP
Не пафосно, но что делать :(
AB
Всем хай! Есть тут люди опытные в криспре? Хочу задать пару вопросов по дизайну sgRNA
O
Не пафосно, но что делать :(
Норм)) я кстати не помню, что у 1000 геномов по публикациям...
DK
Всем хай! Есть тут люди опытные в криспре? Хочу задать пару вопросов по дизайну sgRNA
напиши в лс
AP
Норм)) я кстати не помню, что у 1000 геномов по публикациям...
1000 геномов исходные? они очень долго доили тему, там дофига всего. Но там и сделано по уму - много разных способов, на которых отработали всякое. Они заменили HapMap например. отработали использование low pass, делали LCL клеточки и смотрели на экспрессию, делали трио - дофига всего конечно.
O
1000 геномов исходные? они очень долго доили тему, там дофига всего. Но там и сделано по уму - много разных способов, на которых отработали всякое. Они заменили HapMap например. отработали использование low pass, делали LCL клеточки и смотрели на экспрессию, делали трио - дофига всего конечно.
Я про российские)) А ты про изначальные?
AP
конечно
O
У изначальных то понятно все хорошо))
AP
российские сделали 260 геномов, опубликовали как-то странненько: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30902755
O
российские сделали 260 геномов, опубликовали как-то странненько: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30902755
Вроде там странно только то, что акцент только на трех группах делается. Или я что-то пропустил?
AP
Вроде там странно только то, что акцент только на трех группах делается. Или я что-то пропустил?
и трио не особо в тему, и анализ частот на выборке в 260 человек (это без учета родственности!)
мы-то страдаем от малой выборки, а у нас типа 700
мы-то страдаем от малой выборки, а у нас типа 700
AP
но Геномы России это вообще боль-боль в плане дизайна и политики. Прям портал в ад местами )
O
и трио не особо в тему, и анализ частот на выборке в 260 человек (это без учета родственности!)
мы-то страдаем от малой выборки, а у нас типа 700
мы-то страдаем от малой выборки, а у нас типа 700
Размер выборки - это в целом проблема этого проекта
MS
Извините, что вклиниваюсь, но кто-то использует специальные калькуляторы для расчета molar ratio при лигировании?
O
Извините, что вклиниваюсь, но кто-то использует специальные калькуляторы для расчета molar ratio при лигировании?
А чем обычный плох? Там ведь простая пропорция?
MS
А чем обычный плох? Там ведь простая пропорция?
Пропорции вроде простые, но вот что-то мои расчёты не совпадают с результатами калькулятора неб.
AP
Размер выборки - это в целом проблема этого проекта
да не, там главное политота, она удивительная даже для видавших виды
из всех нор повылезли заинтересованные стороны
Стивен, при всем к нему уважении, не человеческий генетик
в общем шансов сделать хорошо, если подумать, сразу не было
из всех нор повылезли заинтересованные стороны
Стивен, при всем к нему уважении, не человеческий генетик
в общем шансов сделать хорошо, если подумать, сразу не было
O
Пропорции вроде простые, но вот что-то мои расчёты не совпадают с результатами калькулятора неб.
https://nebiocalculator.neb.com/#!/ligation это? Ну, у меня совпадает))
O
да не, там главное политота, она удивительная даже для видавших виды
из всех нор повылезли заинтересованные стороны
Стивен, при всем к нему уважении, не человеческий генетик
в общем шансов сделать хорошо, если подумать, сразу не было
из всех нор повылезли заинтересованные стороны
Стивен, при всем к нему уважении, не человеческий генетик
в общем шансов сделать хорошо, если подумать, сразу не было
А Стивен еще в этом участвует?