Size: a a a

2019 February 25

G

German in Science FYI
моя знакомая искала позицию PhD по биоинфе на следующий год но чтобы не терять год поступила на самую начинающую биоинформатическую работу в MRC в Лондоне - тоже вариант
источник

U

Ulyana in Science FYI
German
моя знакомая искала позицию PhD по биоинфе на следующий год но чтобы не терять год поступила на самую начинающую биоинформатическую работу в MRC в Лондоне - тоже вариант
А она уже в Лондоне это искала или из другой страны?
источник

G

German in Science FYI
Ulyana
А она уже в Лондоне это искала или из другой страны?
из другой страны
источник

U

Ulyana in Science FYI
Прикольно)
источник

G

German in Science FYI
я сам офигел
источник

G

German in Science FYI
https://bioinf.me/education/projects - вот проекты института биоинформатики, можно видеть, что значительная часть из них удалённая (руководитель не из Питера), но вне ИБ получить такой проект для начинающего дело редкой удачи - я такого не знаю не видел
источник

G

German in Science FYI
даже для ИБ это большая проблема - найти руководителей для проектов начинающих биоинформатиков (при условии что в ИБ их учат и контролируют), а просто так руководителю терять время с нестудентом, неработником, который никакими обязательствами не связан и может уйти в любой момент (вместе с данными) вообще не с руки
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
Ilya Gromov
Привет! Меня зовут Илья, недавно закончил магистратуру в Киеве по молекулярной биологии. Я начинающий биоинформатик. Сейчас ищу PhD позицию, но параллельно я бы хотел осмысленно делать какой-то проект по биоинформатике. В Киеве это направление развито слабо, поэтому ищу такую возможность удалённо. Мой основной научный фокус - это геномика и анализ данных NGS. Из интересующих областей биоинформатики я бы выделил single-cell подходы и метагеномику. Подскажите, кто бы мог помочь мне найти проект и ментора? Спасибо!
привет, Илья! прежде всего, я бы советовал инвестировать время в прохождение онлайн-курсов на Stepik и coursera, а также Biostar handbook.

Насчет проекта - есть один человек, которому был нужен биоинформатик для анализа - я могу представить в почте, если ему еще актуально. Но там анализ ChIP-seq на клетках дрозофилы. Подойдет?

Правда, ментором он не сможет быть, тк он биолог с интересом в геномике. Но опыт может быть ценным.
источник

G

German in Science FYI
Alexander Predeus
привет, Илья! прежде всего, я бы советовал инвестировать время в прохождение онлайн-курсов на Stepik и coursera, а также Biostar handbook.

Насчет проекта - есть один человек, которому был нужен биоинформатик для анализа - я могу представить в почте, если ему еще актуально. Но там анализ ChIP-seq на клетках дрозофилы. Подойдет?

Правда, ментором он не сможет быть, тк он биолог с интересом в геномике. Но опыт может быть ценным.
имхо этот случай когда этот самый биолог отчаялся и ему хоть кто бы пригодился для анализа 😆
источник

G

German in Science FYI
если б мне в первый год обучения биоинфе дали проект на чипсеках без научного руководства - я бы прям там и повесился
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
не, научное руководство там вполне может быть - дядька хороший взрослый ученый, ~15 лет в Штатах молекулярщиком работал и тд.

просто детали именно биоинформатики придется рыть самому.
источник

G

German in Science FYI
Alexander Predeus
не, научное руководство там вполне может быть - дядька хороший взрослый ученый, ~15 лет в Штатах молекулярщиком работал и тд.

просто детали именно биоинформатики придется рыть самому.
ну вот чипсеки это ж странный предмет - пик вроде есть, хоп и его уже нет (после какой-нибудь нормализации на бэкграунд когорту). но если проект не горит - можно и на начальном уровне дать порешать...
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
кому там нужен один пик? )
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
взял условные "хорошие", прикинул что-как, может сразу биология на тебя посмотрит
источник

G

German in Science FYI
Alexander Predeus
взял условные "хорошие", прикинул что-как, может сразу биология на тебя посмотрит
мое непрофессиональное мнение о чипсеках - чипсек что дышло, куда повернул туда и вышло 😆
источник

G

German in Science FYI
просто интересно насколько все эти статьи с небольшими когортами реплицируемы на независимых
источник

G

German in Science FYI
отсёк по p-value 0.05 - одни выводы в статье, отсёк по 0.01 - уже другой enrichment по генам и совершенно другие выводы
источник

G

German in Science FYI
впрочем это я так, давайте я лучше поделюсь со всеми крутой статьей
источник

AP

Alexander Predeus in Science FYI
источник

G

German in Science FYI
краудфандинговое исследование генома кошки Lil BUB - https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2019/02/22/556761.full.pdf
источник