MY
В связи с нарушением политкорректности и из-за публичных споров 18 октября 2007 года Совет Попечителей (Board of Trustees) в лаборатории Cold Spring Harbor приостановил административные обязанности Уотсона. 19 октября Уотсон извинился. 25 октября он ушел с поста канцлера лаборатории Колд-Спринг-Харбор в Лонг-Айленде, и был выведен из состава её совета директоров. В 2008 году Уотсон был назначен канцлером почетного члена CSHL. С 2009 года он продолжает консультировать и руководить проектной работой в лаборатории.