GUI графический интерфейс пользователя. Если в краце и немного неправильно, то рабочий стол с которым ты будешь работать после загрузки ОС. В отличие от винды, под Линукс их огромное множество.
Но коллега прав, рабочий стол можно ставить любой, он отделен от ядра, можно вообще без него — на серверных ОС его и нет, только консоль, этим и крут Linux :)