В любом случае удалось пофиксить проблему, создав hciuart.timer, который запускает hciuart.service с некоторой задержкой. Глубже копать у меня, к сожалению знаний не хватит. Потому какая проблема, такое и решение) Больше всего удивляет то, что это не проявляется при загрузке с microsd и та же Raspberry Pi OS грузится что с microsd, что с USB без проблем