Меня убедить пытаются что я дурак, т.к. ставить пакеты на гипервизор плохо, человек вроде авторитетный, вот и появились сомнения
ваш авторитетный коллега - и прав и неправ одновременно). Ставить на хост прикладной софт (файловый сервер, веб-сервер, ВПН, ....) - действительно не стоит. Задача хоста - предоставлять виртуализацию, а все сервисы делаются как виртуальные машины/контейнеры. Но это не относится к утилитам(инструментам), которые можно (и нужно) устанавливать на самом хосте - так как вы не сможете мониторить состояние хоста из виртуальной среды. Поэтому что htop/iotop/iostat - это всё инструменты мониторинга