когда один делаешь сайт в самом деле нет проблем, но проблемы возникают, когда работает 2+человека. Для этого придумали git прочие штуки, но в MODX c его хранением в БД, он бесполезен. Ну и есть некоторые моменты, что в случае прямого использования файловых элементов через pdoTools, уменьшается количество запросов к БД, что значительно снижает нагрузку. В общем, такой подход родился не на пустом месте
Да, я об этом и пишу что причина не просто так. Спасибо