В конечном устройсте, МК сам просыпаться не будет, можно и по кнопке его будить, тем самым запуская преобразователь, подтягивая вывод EN. В общем-то, прошлый вариант был именно такой. Но я искал dc-dc микруху с низким потреблением как раз что бы не лепить такой вариант
есть такая штука, как push button контроллеры, у того же линеара или тексаса можно глянуть, их задача как раз кушать мало, следить за кнопкой включения и по событию запускать все что нужно.
если это пипец как сложно и дорого, то полевик рвущий минус акб и оптрон вам помогут сделать все тоже самое, но несколько дубовее и дешевле