По ощущениям довольно просто всё. rpm5 из далёкого прошлого, потому и работает шустрее, и отлажен.
rpm4 что называется активно развивается. Типа смотрит в будущее.
rpm вообще удачностью реализации не пахнет. Разве что безальтернативностью.
В rpm4 "воспользовались" возможностью современного железа, напихав в ту же мету избыточное количество инфы. Думаю, отсюда и замедление работы.
Начерта вот по автопровайду на каждый чих? Раньше такой фигни не было.