Вот, так ты обычно и объясняй людым.
1) Есть папа бот - в котором может быть список команд и которые он отдаеть в Телеграм клиенте.
2) Команды которые реализовываются на строне Бота могут быть любые и могут даже не реализовывать всё, что напихано в папу бота.
3) Не объязательно выводить эти команды в help
4) Я не знаю средств как получить все команды из бота, если они не описаны в папе бота.
Команды, которые сообщаются юзеру, отданы на откуп создателю бота, да. Хочет — отдаст через хелп, хочет — через ботпапу, хочет — как-то иначе или никак.
Это вообще никак не связано с bot API.
Это если кратко))