В таком варианте есть высокая вероятность что-то забыть или просмотреть и будет весело)) В идеале конечно ручных манипуляций избегать, сам с таким уже отгребал проблем
Опять же, если пойти задним числом то можно сделать три схемы, сделать платы, а потом отдельно сделать общий лист схем. И профит.