тестово всего один документ (всего одна проводка) в этой проводке 2 элемента справочника, по 1шт каждый. итого 2 шт. в отчете выдает 4 шт (по 2 шт каждогого наименования, хотя там по 1 щт)
Грубо говоря, на каждый чих рисуется строчка с остатком, если СКД не объяснить, что там период (регистратор, дата номер строки), а что остаток, то СКД возьмет все значения "Остаток" (на начало, на документ, на конец) и сложет их.