Можно и просто в proxy_pass поменять порт, это в целом тоже самое.
Смотри, у тебя есть прила. Ты когда ее деплоишь, то проверяешь на каком порту запущена предыдущая версия этого приложения, допустим что предыдущая версия на порту 4000. Тогда ты поднимаешь новую версию прилы уже на порту 4001, и в Nginx меняешь proxy_pass
http://127.0.0.1:4001;
Делаешь релоад. А старую прилу которая была на 4000 порту, шатдаунишь.
Когда будешь выкладывать очередную версию, увидишь что текущая прила поднята на 4001 порту, значит тебе нужно повторить все действия в обратно порядке, подняв новую версию на порту 4000.