Хотя можете попробовать добавить при регистрации существующей схемы в качестве новой какой-нибудь комментарий в схему или алиас, это сгенерирует новый ид, но формально, схема будет такая же. Это то еще извращение, но вдруг =)
Тоже думал так, но костыльно. Нашёлся способ проще - можно просто удалить конкретную версию и заново зарегистрировать - инкрементальная последовательность сохранится, просто в ней будет "дырка" - т.е. versions вернёт [1, 3]