АК
Есть вариант data-only pg_dump + sed... но так можно дозаменяться, т.е. заменить строку-название схемы в самих данных (хоть и с крайне низкой вероятностью). ;)
Кстати, почему бы (раз у Вас есть схема в целевой базе), не "потанцевать" с переименованиями схем?
Т.е. временно целевую переименовать под источник, потом обратно?