Со времен провозглашения независимости на Украине, в бассейне Чёрного, Азовского морей, Днепра, Днестра, Южного Буга стабильно обнаруживаются холерные вибрионы, что свидетельствует о наличии стойкого природного очага. В 1991—1996 гг. холеру регистрировали в 14 областях Украины и г. Севастополе, доходя до эпидемического уровня в 1994 (845 больных, летальность 2,6 %) и 1995 (548 случаев, летальность 1,8 %) годах. Наиболее пораженными были южные и центральные регионы страны. В 2011 году в Мариуполе (Донецкая область) из-за случаев холеры был введен запрет на купание на пляжах, а также на ловлю рыбы и продажу её на рынках.