$upstream_response_time - хранит время, затраченное на получение ответа от сервера группы; время хранится в секундах с точностью до миллисекунд.

$upstream_connect_time и $upstream_header_time - это составные части $upstream_response_time, складывать их вместе не нужно.

$request_time -  время обработки запроса в секундах с точностью до миллисекунд; время, прошедшее с момента чтения первых байт от клиента до момента записи в лог после отправки последних байт клиенту.

$request_time = <время чтения запроса> + $upstream_response_time + <время досылки ответа>