можно посмотреть где-то пример, ищу не где не видно((
с ходу пример для условного fastcgi не найду, как я понимаю реч идет о php скриптах?
но это делается точно так же как вы бы делали разные location для например разных proxy_pass.
только в случае fastcgi нужно указать -
fastcgi_index my_script.php;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /project/path/public/my_script.php;