Если человек хорошо знает прототипы - это тоже как-то его характеризует. Либо давно работает с JS, либо сам глубоко копает. Не обязательно же душнить, можно спросить: "Прототипы знаешь?" и, если нет, то искать другую тему. Я пытаюсь на собесах найти те темы, в которых кандидат хорошо разбирается и поговорить про них. Это, как мне кажется, даёт более полную картину, что это за человек и чем интересуется.