У вм есть лимит на длину одной csv строки. Похоже, вы упираетесь в него. У вас в одной строке больше 200кб данных? У вм нет лимита на количество строк в одном запросе - она должна прожевать хоть миллиард строк, отправленных через один запрос.
Да, на лимит и наплролся, но проблема была, как выше написал, в том что курл склеивает строки из файла, если не binary использовать.