В 1964 г. власти Занзибара и Танганьики подписали соглашение о создании единого государства — Танзании (название является комбинацией слов «Танганьика» и «Занзибар»).
Новый флаг Занзибара был впервые поднят в январе 2005
Острова Занзибар являются полуавтономией в составе Танзании с административным центром в городе Занзибар. С 2005 года Занзибар имеет собственный флаг, парламент, а также существует свой президент