Нормальная ли практика приходящие из API массивы в коллекции форматировать чтобы работать с ними?
Я слышал, что это по сути трансформеры API, но я это примитивно делаю просто переводя в collect($array).
Мб есть хелпер/пакет который лучше использовать?
Зависит от необходимости. Оборачивая в коллекцию, ей становится только первый уровень. Все вложенные так и будут массивами.
Если нужен специфичный функционал коллекций, то да, стоит. А если он совпадает с хелперами для массива или вообще не использует, то смысла в этом нет, только память сожрёт.