ребят, сорри за нубский вопрос... а почему такое может быть, что IDEA запускает SpringBootApplication и graddle в 2х разных потоках? например, чтобы остановить приложение из IDEA теперь надо выбирать stopAll и в Debugger теперь 2 разные закладки (одна с харакретным значком graddle)...
это если debug режим, если просто запустить то будет одно окно с логотипом graddle