Окей... раз уж пошла риторика: "нет так, нет так", то придётся свой вариант обосновать.
В одном файле содержится только код приложения. Он загружается в память браузера и выполняется.
В разделённом на чанки приложении содержится немалое количество кода, отвечающее за подгрузку чанков и взаимодействия между ними, что даёт какой-то оверхед. Ну и сама по себе необходимость догрузить что-то, что ещё не грузилось прямо во время выполнения приложения ещё какой оверхед.