А часовая пауза в работе вас вообще не смущает? Скорее всего ваша программа не настроена для работы в фоновом режиме и система её регулярно усыпляет.
Программа становится в паузу на час после выполнения 50-60 действий. Потом продолжает дальше. Та сразу это проверил, даже при включенном экране наблюдается та же фишка. Скажите если хочу переустановить программу(обычно мелкие глюки этим решаются) нужно какую то информацию сохранить?