Я при имеющейся мвв въезжал по обычному трехлетнему шенгену и после этого успешно получал карточку. Пересечение границы как мне кажется - никак не связано с процессом
На сайте IND в правилах получения мвв написано, что ты не имеешь права наодиться на территории Ни, пока они рассматривают твой аппликейшен. Но что тебе будет за это нарушение, мы так и не нашли