Хотя технологически Atari Lynx во всём превосходила Game Boy, маркетинговое давление Nintendo, использование «чужих» разработчиков, задержка с выходом игр № 1 (в первую очередь, Tetris) привело к тому что консоль стали считать второстепенным продуктом на рынке. Также она пострадала от необходимости ставить большее число элементов питания (шесть против четырёх в Game Boy), которые к тому же израсходовались намного быстрее. Более мощный процессор и подсветка разряжали шесть элементов AA за 4 часа (5-6 часов для Atari Lynx II)[1].
Корпус Atari Lynx был больше, чем необходимо. Компания Atari поверила результатам одного исследования, в котором потребители говорили, что хотят большие корпуса, так как это даст им «больше возможностей за их деньги».