Пусть старшие товарищи меня поправят, но КМК тут есть шанс спалить микроконтроллер примерно по той же схеме, когда выгорают USB порты ноутбука при подключении к ним устройства со своим сетевым питанием. Когда между "землями" их БП возникает напряжение вольт в 40. Но если всё воткнуто в один удлиннитель, то проблемы, скорее всего, не будет.
Можно развязать оптопарой, но это уже сложнее