Не, они идентичны по функционалу +-. yarn был быстрее до 6 ветки npm в плане разрешения пачек зависимостей твоих зависимостей, потом разница стала незаметна.
Нода очень хороша а) для прототипирования. Быстро, модно, молодёжно б) для общения с конечными клиентами, типа собрать пачку данных с микросервисов и запулить кому-то. жсон это про ноду.