По мне так самый очевидный способ обновления конфигов вот такой:
1) Поднимаем новый инстанс с новым конфигом, проверяем что он норм запустился
2) Направляем трафик туда, ждем пока на старом приложении не останется трафика
3) Убиваем старый инстанс.
Еще и деплоем отдельным считал бы это обязательно.
Я против релоада конфига, у нас прод такой периодически валит из-за человеческого фактора, а такая штука увеличивает этот фактор.