если ты записываешь в custom - это уже настройки редактора
Да, но это настройка которую мне не нужно сохранять или таскать с машины на машину. Такая же как список установленных пакетов или безопасных тем которые точно так же в кустоме лежат.
Если custom не кошерен, а вручную команды прописывать лень, то можно по идее просто заадвайсить safe-local-variable-p что бы она всегда true возвращала