тут бяда - если ты хочешь tensorflow-gpu, то тебе нужно иметь установленные в систему либы для работы с гпу
Это проблема пм языков программирования, все они имеют проблемы обвязки системных библиотек. А системные пакетные менеджеры фиксируют (обычно) одну версию пакета на всю систему. В этом плане nix/guix лучше условных pip и apt.