Мне пришлось дропнуть таблицу и пересоздать, благо это таблица с кешем. Место освободилось, но сдается мне что где-то бага на стороне друпала
Конвертация - это по сути тоже пересоздание, только не нужно думать, как структуру не потерять)) да и данные в общем-то тоже. Мне кажется, что это баг именно mysql. Да, он проявляется только в тех таблицах, куда друпал часто что-то пишет. Но думаю друпал тут ни при чём