Это же с какой версии, например BIND надо не обновлять. Мельком пробежал Changelog - не нашел.
Ну еще кейс, если вы рубите TCP трафик к DNS - тоже даст проблему (но это давно уже проблема).
Из всех доменов, что я посмотрел проблемы будут только у
rt.ru. И то, это касается только
ns8-cloud.nic.ru