Это бд используется только для этой системы, так что наверное так и было задумано, но вопрос все еще состоит в том, могу ли я при отправке запроса каким либо образом html теги убрать? через регулярные выражения или что то такое
Регулярные выражения, как известно, не могут распарсить HTML.
Ты должен был это все обработать ДО помещения в БД, например, есть хорошая библиотека для этого - gumbo.
СУБД для этого не предназначено