Стандартная установка была по сути, 1 сайт, 1 MP, клиентов под 500. Траблы с notification server и тем что все показаны как оффлайн начались после переключения на https и обратно
Ну это мелочи - 500 клиентов... Смотрите чем таким SQL занят. самое простое - остановите службу ccmexec и проверьте, уйдет ли завал на SQL
Затем включите обратно, остановите sms_executive - и проверьте CPU опять