Если на активной ноге SQL кластера установлен backup сервис только для primary passive и отсутствует для primary active, в какую сторону копать?
Колдунство какое-то. Создал сам на системном диске "глючной" ноги кластера директорию SMS_(active_primary_FQDN), перезапустил SMS_SITE_COMPONENT_MANAGER и все поставилось. И бекап прошёл.