Миграций будет меньше. Она отставшая от мастера например
И? Еще раз, у тебя есть стейджинг на котором накачены миграции, ты знаешь их список.
У тебя есть ветка, ты знаешь какие миграции есть там.
Перед тем, как разворачивать ветку ты просто откатываешь стейджинг назад до последней общей миграции.