Не можно, а необходимо. Только так и надо делать. Накопитель не должен быть куда-то подключён, и это должно отдельно обеспечиваться и контролироваться, - что он именно не подключён никуда.
В правильном дизайне, устройство хранения резервных копий самостоятельно ходит за этими резервными копиями, что исключает вероятность его шифрования и прочего негативного воздействия.