Два коннекта к разным базам и дальше ручками?
Здесь уже до чего дофантазируешься. Если есть предпосылки поменять базы, переехать в единую или ещё чего — делаешь абстракцию через функцию, протокол, что там ещё придумаешь. При таком раскладе можно даже абстрагироваться от того, что у тебя больше одной базы, чтобы не смешивать логику бизнеса с деталями реализации.