Просто если записывать диск совсем в ноль пустоты - последний плот будет сильно фрагментирован, так устроена нтфс, между файлами всегда есть «зазор», они не пишутся вплотную, и последний файл получается разорван на куски, записанный в этих «пустотах». Вот и вся «боль» этого. Если редкий извращенец - можно дефрагментатором слить все воедино без дырок (только нужно специальный Дефраг) и потом записать целиком плот в конце, но это уже редкий тип извращения