1) надежнее.
2) меньше конвертаций напруги и падения кпд на нагрев. В случае питания через 2 усб напряжение будет идти:
12 вольт бп -> 5в усб -> снова 12в в переходнике на винт 3.5".
При подключении 12в напрямую с бп - нет этих преобразований, меньше жрет энергии
3) меньше нагрев, меньше нагрузка на цепи питания матери
4) не нужно дополнительные usb